MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 1

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008498	TAA	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334868
2	NC_008498	TTTC	2	8	521	528	0 %	75 %	0 %	25 %	116334868
3	NC_008498	TTCT	2	8	625	632	0 %	75 %	0 %	25 %	116334868
4	NC_008498	T	7	7	744	750	0 %	100 %	0 %	0 %	116334868
5	NC_008498	ATACT	2	10	770	779	40 %	40 %	0 %	20 %	116334868
6	NC_008498	AAG	2	6	782	787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334868
7	NC_008498	ACT	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334868
8	NC_008498	TCA	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334868
9	NC_008498	CAA	2	6	849	854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334868
10	NC_008498	ACC	2	6	919	924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334868
11	NC_008498	TCAT	2	8	941	948	25 %	50 %	0 %	25 %	116334868
12	NC_008498	TTTA	2	8	1048	1055	25 %	75 %	0 %	0 %	116334868
13	NC_008498	T	6	6	1057	1062	0 %	100 %	0 %	0 %	116334868
14	NC_008498	TA	3	6	1066	1071	50 %	50 %	0 %	0 %	116334868
15	NC_008498	AAT	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334868
16	NC_008498	CTG	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334868
17	NC_008498	TTC	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334868
18	NC_008498	AT	3	6	1623	1628	50 %	50 %	0 %	0 %	116334869
19	NC_008498	T	8	8	1688	1695	0 %	100 %	0 %	0 %	116334869
20	NC_008498	CAA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334869
21	NC_008498	T	7	7	1762	1768	0 %	100 %	0 %	0 %	116334869
22	NC_008498	CATTTC	2	12	1790	1801	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116334869
23	NC_008498	TTAT	2	8	1809	1816	25 %	75 %	0 %	0 %	116334869
24	NC_008498	TCGAG	2	10	1855	1864	20 %	20 %	40 %	20 %	116334869
25	NC_008498	ATT	2	6	1904	1909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334869
26	NC_008498	GTCC	2	8	1931	1938	0 %	25 %	25 %	50 %	116334869
27	NC_008498	TTA	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334869
28	NC_008498	TCT	2	6	2039	2044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334869
29	NC_008498	ATC	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334869
30	NC_008498	ATT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334869
31	NC_008498	CCA	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334869
32	NC_008498	ATC	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334869
33	NC_008498	A	6	6	2105	2110	100 %	0 %	0 %	0 %	116334869
34	NC_008498	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334869
35	NC_008498	GAA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334869
36	NC_008498	AATA	2	8	2215	2222	75 %	25 %	0 %	0 %	116334869
37	NC_008498	TAA	2	6	2263	2268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334869
38	NC_008498	CT	3	6	2291	2296	0 %	50 %	0 %	50 %	116334869
39	NC_008498	TCT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334869
40	NC_008498	CTT	2	6	2341	2346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334869
41	NC_008498	CTT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334869
42	NC_008498	ATTT	2	8	3021	3028	25 %	75 %	0 %	0 %	116334870
43	NC_008498	CAT	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334870
44	NC_008498	ATC	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334870
45	NC_008498	CTT	2	6	3127	3132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334870
46	NC_008498	TGT	2	6	3197	3202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334870
47	NC_008498	TGAT	2	8	3441	3448	25 %	50 %	25 %	0 %	116334871
48	NC_008498	CTAT	2	8	3480	3487	25 %	50 %	0 %	25 %	116334871
49	NC_008498	A	6	6	3494	3499	100 %	0 %	0 %	0 %	116334871
50	NC_008498	TGG	2	6	3560	3565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334871
51	NC_008498	GCA	2	6	3594	3599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334871
52	NC_008498	ATTTTT	2	12	3635	3646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116334871
53	NC_008498	CTG	2	6	3681	3686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334871
54	NC_008498	TTA	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334871
55	NC_008498	T	6	6	3721	3726	0 %	100 %	0 %	0 %	116334871
56	NC_008498	TGG	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334871
57	NC_008498	GGTTT	2	10	3833	3842	0 %	60 %	40 %	0 %	116334871
58	NC_008498	TGG	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334871
59	NC_008498	AAG	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334871
60	NC_008498	CTG	2	6	4198	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334871
61	NC_008498	ATT	2	6	4271	4276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334871
62	NC_008498	TAAT	2	8	4317	4324	50 %	50 %	0 %	0 %	116334871
63	NC_008498	TGA	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334871
64	NC_008498	CGA	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334871
65	NC_008498	ATC	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334871
66	NC_008498	CAA	2	6	4799	4804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334871
67	NC_008498	GGT	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334871
68	NC_008498	TCG	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334871
69	NC_008498	CTT	2	6	4911	4916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334871
70	NC_008498	CAA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334871
71	NC_008498	GAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334871
72	NC_008498	TGA	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334872
73	NC_008498	TGC	2	6	5263	5268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334872
74	NC_008498	GCA	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334872
75	NC_008498	CCA	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334872
76	NC_008498	TGC	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334873
77	NC_008498	CGCT	2	8	5585	5592	0 %	25 %	25 %	50 %	116334873
78	NC_008498	TCA	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334873
79	NC_008498	CAA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
80	NC_008498	A	6	6	6726	6731	100 %	0 %	0 %	0 %	116334874
81	NC_008498	GT	3	6	7074	7079	0 %	50 %	50 %	0 %	116334874
82	NC_008498	GC	3	6	7154	7159	0 %	0 %	50 %	50 %	116334874
83	NC_008498	AAG	2	6	7391	7396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334874
84	NC_008498	A	6	6	7409	7414	100 %	0 %	0 %	0 %	116334874
85	NC_008498	CAA	2	6	7444	7449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
86	NC_008498	TCAA	2	8	7460	7467	50 %	25 %	0 %	25 %	116334874
87	NC_008498	CGT	2	6	7529	7534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334874
88	NC_008498	CAA	2	6	7540	7545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
89	NC_008498	CAG	2	6	7549	7554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334874
90	NC_008498	GAC	2	6	7593	7598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334874
91	NC_008498	AAC	2	6	7603	7608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
92	NC_008498	CAA	2	6	7620	7625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
93	NC_008498	TCAG	2	8	7697	7704	25 %	25 %	25 %	25 %	116334874
94	NC_008498	GAC	2	6	7774	7779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334874
95	NC_008498	TAG	2	6	8194	8199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334875
96	NC_008498	CAAC	2	8	8202	8209	50 %	0 %	0 %	50 %	116334875
97	NC_008498	TGT	2	6	8210	8215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334875
98	NC_008498	TCT	2	6	8227	8232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334875
99	NC_008498	TCA	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334875
100	NC_008498	TCT	2	6	8253	8258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334875
101	NC_008498	GCC	2	6	8260	8265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116334875
102	NC_008498	AGT	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334875
103	NC_008498	AAT	2	6	8312	8317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334875
104	NC_008498	CTT	2	6	8347	8352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334875
105	NC_008498	ATC	2	6	8406	8411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334875
106	NC_008498	TGG	2	6	8437	8442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334875
107	NC_008498	TGT	2	6	8497	8502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334875
108	NC_008498	AAG	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334875
109	NC_008498	TGT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334875
110	NC_008498	TGA	3	9	8631	8639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334875
111	NC_008498	TA	3	6	8714	8719	50 %	50 %	0 %	0 %	116334875
112	NC_008498	GTC	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334875
113	NC_008498	TTCT	2	8	9030	9037	0 %	75 %	0 %	25 %	116334875
114	NC_008498	AAAAT	2	10	9097	9106	80 %	20 %	0 %	0 %	116334875
115	NC_008498	TCA	2	6	9121	9126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334875
116	NC_008498	TTG	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334875
117	NC_008498	GAA	2	6	10004	10009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334876
118	NC_008498	AAGC	2	8	10066	10073	50 %	0 %	25 %	25 %	116334876
119	NC_008498	ATC	2	6	10092	10097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334876
120	NC_008498	TGCT	2	8	10125	10132	0 %	50 %	25 %	25 %	116334876
121	NC_008498	CAAG	2	8	10198	10205	50 %	0 %	25 %	25 %	116334876
122	NC_008498	ATG	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334876
123	NC_008498	CAG	2	6	10295	10300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334876
124	NC_008498	TCT	2	6	10369	10374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334876
125	NC_008498	TCT	2	6	10379	10384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334876
126	NC_008498	CCA	2	6	10407	10412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334876
127	NC_008498	ATA	2	6	10449	10454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334876
128	NC_008498	CAAG	2	8	10471	10478	50 %	0 %	25 %	25 %	116334876
129	NC_008498	GTT	2	6	10490	10495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334876
130	NC_008498	ATAAAA	2	12	10524	10535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334876
131	NC_008498	TGG	2	6	10547	10552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334876
132	NC_008498	AGA	2	6	11209	11214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334877
133	NC_008498	AAG	2	6	11250	11255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334877
134	NC_008498	CAA	2	6	11264	11269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334877
135	NC_008498	GAG	2	6	11390	11395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116334877
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.